去任山西巡抚时因斥骂手下，暴虐属员，勒索无厌而被罢官。嘉庆帝对他宽大处理，流放他到伊犁，后来又把他从伊犁召回，亲自接见他。伊桑阿在皇上面前痛哭流涕，说：“奴才若不侮改，猪狗不如。”于是嘉庆帝又让他去贵州做巡抚。

    初彭龄在奏折中说：“伊桑阿市经莅任，便故态复萌，因沿途州县供应不周，即肆口谩骂；州县办差稍不如意即行撤回；又将黔抚衙署全行拆改，添造置房数十间，耗银六千余两，又不发作，以扣缴养廉不足为名，勒令各府帮贴；甚至纵容家人逞威作势，索取属员门包；更有甚者，于石岘之战中，其驻扎铜仁，并未亲赴军营，却诳报上阵歼敌，扫荡逆剿，全境肃清，骗得交补议叙。”

    另一个奏折是劾揭吏部书吏竟然欺蒙上司，私用印信舞弊，愚弄五部堂司乃至侍郎尚书，吏部京兆相争一事，任书吏颠倒是非，变动案例。

    两个奏折，摆在案头，令嘉庆帝恼怒异常，可又觉得无从治起。治军队恐无人任帅，治朝廷，恐朝中无可当大任之人。正在忧愁时，朱珪登殿奏曰：“皇上，如今再不能手软了。军中，虽然可令那些渎职将帅戴罪立功，可是他们确是除贪婪淫乐之外，剩下的只有昏庸无能，如果再对他们放纵，实在于国不利。教匪之乱，绝不能再拖延下去了。且皇上初政刚一年，去岁诛杀和珅，下诏求言，万民称快，国运昌隆，如今沉滓复起，贪污腐败之风气又有死灰复燃之势，皇上绝不可犹豫以待，令其形成势头习惯，从中央到地方该是狠心整治的时候了——应该像诛杀和珅一样。”

    朱珪的话，说到了嘉庆帝的心坎上，于是道：“朕正要整治中央、地方及军队，可一时黜去如此众多的大吏，新人从何而出？”

    朱珪道：“臣想皇上最担心的是军中帅才，臣保举一人可担此任，此人叫额勒登保，旧属勇将海兰察麾下。胡齐崙挪用军饷馈送于诸将帅，唯独额勒登保拒而不受。其军中运饷之困难，也都由其自行筹办，从无借口为难。近二年来，诸军无不畏缩不前，而唯有额勒登保左突右击，而且从不虚冒功劳。额勒登保不仅是善战的勇将，而且还是廉洁谨慎的官吏，这样的人一定可以做领兵统将的元帅。经略之职交于此人，南方教匪可定矣！——至于中央官员可选贤任能，不拘一格，要善于发现新人；地方大吏，更不足虑也——也不必虑及太多。”

    嘉庆帝此时觉得洪亮吉确有爱君之诚，于是首先下诏释放洪亮吉，决心重新举起剔除积弊、革新国政的大旗。刚好，此时京师大旱连月无雨，皇上多次祷雨未应，哪知皇上赦洪亮吉回籍的诏书刚下，京师即普降大雨，连月之旱，一夕解除。嘉庆帝得此效验，立即大刀阔斧地整顿起来。

    首先处理了军队的一批旧将，诏逮勒保，判斩监候，明亮逮京问罪，永保拟处斩，后诏免斩流放。秦承恩重新处置，与宜绵、庆成等一起皆远戍伊犁，其余贻误军机之大小将官亦俱受惩处。同时授额勒登保经略印信，军队从此开始转人节节胜利。不过勒保明亮又复起用。

    对伊桑阿则立即斩首——这是嘉庆亲政后从快惩处贪赃大吏的第一个案例。

    对吏部书吏舞弊一案，嘉庆帝也毫不留情，吏部尚书书琳宁被革去协办大学士及尚书职务；吏部传郎范建丰、钱钺亦被革职；军机大臣刘权之亦交都察院严加论处，兵部尚书兼顺天府尹戴衢亨亦交都察院议处。同时选年富力强的英和入值军机处。

    嘉庆帝如此痛下决心，大刀阔斧，雷厉风行的整顿，又给国家带来生机。

    额勒登保是满州正黄旗人，在海兰察麾下时，曾讨台湾，远征廓尔喀，每战必策马前冲，争先陷阵。海兰察曾对他说道：“你真是个将才，可惜不识汉字。我有一本满文的兵书，是从汉文译过来的，你熟读以后，他日定会成为名将。”